保證金是指商家以“一店鋪一保證金”原則向京東繳納的用以保證其商品和服務質量的租金，京東可以依照雙方簽署的協議或平臺規則進行處置。
入駐時商家就需向京東繳納固定金額保證金，次年續簽時無需重復繳納。不同商家類型、不同品類收取金額不同。需要注意的是：跨類目保證金采用就高原則，經營過程中增加類目與原有保證金不一致，須補交差額部分。
退還規則：若商家主動退出京東或被清退，需要在所有訂單終止、索賠、交易的產品質保期屆滿后，自終止合作之日起滿3個月后可申請發起退款。
由于保證金的收取形式為押金形式，在商家退店時會進行退還，故保證金僅能開具電子收據形式，無法開具發票。其次是平臺使用費此費用為商家依照與京東簽署的相關協議使用京東開發平臺各項服務時繳納的固定技術服務費用。
除POP商家部分類目及京喜商家外，平臺使用費按照距離次年3月每月1000元的規格收取，根據商家入駐時間不同，費用會有差別。
若繳納費用時間為當月1-15日（含），繳費金額為（15-N）*每月平臺使用費（N為繳納費用時所處月份）
若繳納費用時間為當月15日后（不含），繳納金額為【15-（N+1）】*每月平臺使用費（N為繳納費用時所處月份）
繳納完成3天后，即可在商家后臺結算管理模塊中開具平臺使用費發票。
需要注意的是：若同時經營多個商家（有多個商家ID的），需要按照商家數量繳納平臺使用費。商家撤店時不退還平臺使用費。
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