成功案例丨榮聯助力中科院上海有機所冷凍電鏡大數據計算系統建設

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中國科學院上海有機化學研究所(簡稱上海有機所)是集基礎研究、應用研究和高技術創新研究為一體的綜合性化學研究機構，是中國科學院首批成立的 15 個研究所之一。從開展抗生素和高分子化學的研究起步，在以有機化學研究為中心的基礎研究、應用研究與高新技術開發、人才培養等方面均取得令人矚目的成就。

上海有機所立足基礎交叉前沿領域，堅持重大科學問題和國家重大需求導向，發揮有機合成化學的創造性，加強與生命科學、材料科學的交叉與融合;致力于推動我國化學轉化方法學、化學生物學、有機新材料創制科學等重點學科領域的發展。

上海有機所冷凍電鏡大數據計算系統建設方案

為了上海有機所能夠完成高效、專業的科學研究，榮聯為上海有機所提供了全套的冷凍電鏡數據分析計算、存儲解決方案，主要應用于冷凍電鏡的數據采集、預處理、分析處理、三維重構、數據三維可視化等環節，部署自動化數據處理流程。

通過部署冷凍電鏡大數據計算系統，實現計算功能、存儲功能、Linux 3D 桌面云功能、集群管理與多用戶作業隊列管理功能和用戶存儲配額管理功能，同時完成對集群管理軟件系統、電鏡數據處理流程相關軟件、自動化電鏡數據采集與處理流程腳本等內容的安裝調試。

服務器層面，采用CPU+GPU系統計算服務器，均使用國有自主品牌高性能機架式服務器，適用于AI云、生命科學、醫療等應用場景;

存儲層面，采用完全分布式的、統一的存儲系統，提供便捷部署且可大規模擴展的集群存儲平臺，基于集群技術、分布式文件系統，提供文件存儲服務，集群存儲系統可輕松擴展到數PB容量;

采用3D 云桌面系統提供多用戶同時在線計算作業，通過 Web Linux桌面進行Relion/MotionCorr2/Pymol/Coot/CCP4等業務軟件的作業提交、作業監控與數據管理，支持用戶通過 Web Linux桌面實時處理3D性能加速的Linux桌面應用;

計算、存儲設備配置Infiband接口，和原設備IB互聯，配置千兆交換機，作為管理網絡;

科學研究更加高效

通過冷凍電鏡大數據計算系統的建設，上海有機所具備了完全的冷凍電鏡結構分析能力，借助該系統打通下機數據采集、傳輸壁壘，直接接入和控制冷凍電鏡光學系統，實現從數據采集到二維和三維生物結構的分析，使數據預處理、數據可視化更加高效。

著眼于各種規模的冷凍電鏡設施，針對多用戶場景下規?；睦鋬鲭婄R數據計算實踐中的痛點問題，上海有機所冷凍電鏡大數據計算系統支持全自動化的數據分析流程和實時數據質量信息反饋，具有完備的、可視化的數據管理以及計算歷史追蹤和統計分析能力。

目前，榮聯冷凍電鏡數據分析平臺解決方案主要應用于生命科學蛋白質結構解析工作線中，已成功服務于清華大學、水木未來等重點行業客戶，積累了豐富的行業經驗。

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